Если есть личный кабинет на сайте налог.ру с паролем, который Вы оформляли в налоговой, то там проще всего. Можно отследить все стадии: поступление документов, проверку и т.д. Но обратите внимание, что вес сканов лучше уменьшить, чтобы все документы поместились, там ограничение по об'ему а загружаемых материалах. А так все не сложно, просто нужно сначала все материалы отсканировать, потом уменьшить и загрузить в кабинет. Ну и декларацию не забудьте за соответствующий год заполнить. 2-ндфл обычно в кабинете уже есть, т.к. его подаёт своевременно работодатель. Еще вариант скачать форму декларации с сайта налог.ру (это программа), установить на комп, заполнить правильно декларацию (если сомневаетесь, можно на горячую линию к ним позвонить, спросить о том, в чем сомнения), распечатать и принести вместе с копиями в налоговую, пусть сами с ними работают. Это вариант, если нет личного кабинета.