Да, действительно, так сделали 2-3 месяца назад.
Понимаю неудобства, но пока все же склоняюсь к мнению, что такое вариант более правильный и менее глючный.
PS: Будем делать для мессенжера отдельную страницу (не всплывающее окно) - в нем будет удобно вести длинную/продолжительную переписку. Этот вариант решит проблемы.